量子计算助力创新药物研发,技术升级引领制药业革命

  制药业是一个与人类健康和生命息息相关的行业,它也是一个不断创新和进步的行业。在过去的几十年里,制药业经历了从化学合成药、生物制品药、基因工程药、纳米药物等不同阶段的发展,涌现了许多具有重大意义和影响的新型药物,为治疗各种疾病和改善人类福祉做出了巨大贡献。同时,制药业也面临着从市场竞争、法规政策、社会需求等多方面的挑战和压力,需要不断适应变化和寻求突破。其中,药物研发是一个复杂而漫长的过程,它涉及到对分子结构、化学反应、生物活性等多方面的模拟和优化。传统的计算机在处理这些问题时,往往受到计算能力、时间和成本的限制,难以达到理想的效果。而量子计算机则可以利用其强大的并行性和精确性,对分子系统进行高效的模拟和搜索,从而加速药物设计的进程,降低药物开发的风险,提高药物质量和安全性。

  量子计算作为一种新兴的技术领域,为制药业带来了新的机遇和希望,也提出了新的要求和问题。量子计算可以为制药业提供新的思路和方法,帮助制药企业提升研发能力,加速创新速度,降低开发成本,提高产品质量,拓展市场空间。但是,量子计算也需要制药企业投入更多的资源和精力,掌握更多的知识和技能,建立更好的合作和沟通,解决更多的难题和风险。

  本期二十五周年专栏中,我们关注量子计算在药物研发中的原理、应用和前沿进展的认识和看法,以及对量子计算对制药业未来发展的影响和启示的思考和建议,希望提供一个全面而深入的视角,更好地了解量子计算这一革命性的新技术在药物研发领域中的作用和价值,以及它对制药业未来发展的挑战和机遇。

  量子计算在药物研发中的原理

  药物研发是一个涉及到多学科交叉的领域,它需要对分子结构、化学反应、生物活性等多方面进行深入的研究和分析。其中,一个关键的步骤就是药物设计,即根据目标受体或酶的结构和功能,设计出能够与之结合并产生预期效果的候选药物分子。这个过程通常包括几个阶段。

  首先是分子对接,通过计算机模拟分析候选药物分子与目标受体或酶之间的空间构型、相互作用能量、结合模式等参数,筛选出最优化的配体。然后是分子动力学,通过计算机模拟分析候选药物分子与目标受体或酶在不同温度、压力、溶剂等条件下的运动轨迹、稳定性、可行性等参数,评估其动态行为。接下来则是药效预测,通过计算机模拟分析候选药物分子在体内外环境中的代谢途径、生物利用度、毒性副作用等参数,预测其药理活性。

  每个阶段都需要对大量复杂的分子系统进行精确而高效的模拟和搜索,这对传统的计算机来说是一个巨大的挑战。传统的计算机使用二进制比特作为信息单元,每个比特只能表示0 或1 两种状态。因此,要表示一个n 位长的分子结构,就需要n 个比特。而要表示一个含有n 个原子的分子系统,则需要2n 个比特。这意味着随着分子系统规模的增加,所需的比特数将呈指数级增长,超出了传统计算机的存储和处理能力。

  而量子计算机则使用量子比特作为信息单元,每个量子比特可以同时表示0 和1 两种状态,这就是量子叠加的特性。因此,一个量子比特可以表示两个分子结构,n 个量子比特可以表示2n 个分子结构。这意味着量子计算机可以利用其并行性,同时处理多个分子系统,大大提高了计算效率。此外,量子计算机还可以利用量子纠缠的特性,实现对分子系统的精确控制和测量,从而提高了计算精度。

  量子计算在药物设计中,可以利用量子搜索算法(如Grover 算法),在指数级的候选药物分子中快速找出最优化的配体;也可以利用量子模拟算法(如变分量子本征求解器VQE),在多项式级的时间内模拟分子系统的本征态和本征能。此外在药效预测方面,利用量子机器学习算法(如量子神经网络QNN),可以在多项式级的时间内学习和预测分子系统的药理活性。

  在药物研发中的应用

  量子计算在药物研发中的应用已经引起了全球各大制药公司、科研机构和技术企业的广泛关注和投入。例如,2021 年,谷歌(Google)与全球领先的研发驱动制药公司勃林格殷格翰(Boehringer Ingelheim)达成合作协议,专注于研究和实施量子计算在药物研发领域中的前沿用例,其中包括分子动力学模拟。新的合作关系将其在计算机辅助药物设计、计算机建模领域的专业知识,与作为量子计算机和算法的领先开发商之一的谷歌所拥有的优质资源结合在了一起。

  而此前,2018 年,微软(Microsoft)与凯斯西储大学(Case Western Reserve University)合作,为了改善病人的护理,凯斯西储使用微软的量子启发的算法,以加强其检测癌症肿瘤的方法。

  埃森哲(Accenture)和默克(Merck)在2018 年与亚马逊网络服务(AWS)合作,推出了一个基于云的信息学研究平台,帮助生命科学行业的组织在药物开发的早期阶段提高生产力、效率和创新。通过为核心研究功能创建开放的、行业标准的应用程序编程界面,使研究人员能够迅速采用新的功能,从而建立一个加速创新的生态系统。科学应用提供商、内容提供商和技术创新者将受益于较低的进入壁垒,新的能力更容易进入市场,帮助生命科学公司重新设想过程、用户体验和数据密集型研究方法。

  前沿突破

  今年初,谷歌宣布,在纠正当今量子计算机固有的错误方面取得了突破,其的研究结果已发表在《自然》(Nature)期刊上。研究人员表示,他们已经找到了一种方法,可以将量子计算机处理的信息通过多个量子比特传播,这意味着整个系统可以保留足够的信息来完成计算,即使单个量子比特脱离了它们的量子态。这是一个重要的里程碑,为实现大规模和高质量的量子计算奠定了基础。

  另一方面,通过互联网提供远程访问和使用量子计算机资源的服务,可以让更多的用户和开发者享受到量子计算的便利和优势。目前,谷歌、微软、IBM、亚马逊等技术巨头都已经推出了自己的量子云服务平台,并与各大制药公司、科研机构和技术企业建立了合作关系,共同探索量子计算在药物研发领域中的应用场景和解决方案。

  量子计算对制药业未来发展的影响和启示

  量子计算作为一种革命性的新型计算模式,对制药业未来发展将产生深远而广泛的影响和启示。在创新药物研发方面,量子计算可以大大提高药物设计的效率和精度,从而加速创新药物研发的进程,降低药物开发的风险和成本,提高药物质量和安全性。这将为人类健康带来新的希望和福祉,尤其是对于一些难治性疾病、罕见病、新型病毒等领域。

  而对于制药业转型升级来说,量子计算可以为制药业提供新的技术驱动力和竞争优势,促进制药业转型升级,实现从传统制造型向智能创新型的跨越。这将要求制药企业加强对量子计算技术的关注和投入,培养和引进量子计算人才,建立和完善量子计算基础设施和生态系统,与量子计算技术提供商建立紧密的合作关系。

  此外,对于无法忽视的制药业监管和伦理,量子计算也会给制药业带来新的挑战和风险,例如数据安全、知识产权、社会责任等方面。这将要求制药业加强对量子计算的监管和伦理,制定和遵守相关的法律法规、标准规范、道德准则等,保护和尊重个人隐私、公共利益、人类尊严等。

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